農(nóng)村合作醫(yī)療保險和職工醫(yī)療保險的區(qū)別有：

第一，二者所覆蓋的對象不同

參加農(nóng)村合作醫(yī)療保險只有農(nóng)村戶口的人才能夠辦理，其他非農(nóng)戶口不能辦理; 而職工醫(yī)療保險，城鎮(zhèn)所有用人單位及其職工都要參加。

第二，二者繳費(fèi)主體不同

農(nóng)村合作醫(yī)療的繳費(fèi)主體是農(nóng)民個人、集體和政府，通過三方面籌資來保障這份保險能夠?yàn)檗r(nóng)民百姓提供醫(yī)療保障; 職工醫(yī)療保險的繳費(fèi)主體是勞動者和用人單位，通過這兩方面籌資來保障這份保險能夠?yàn)閯趧诱咛峁┽t(yī)療保障。

第三，二者繳費(fèi)方式不同

1、所覆蓋的對象不同。

職工醫(yī)療保險是城鎮(zhèn)所有用人單位，包括企業(yè)(國有企業(yè)、集體企業(yè)、外商投資企業(yè)、私營企業(yè)等)、機(jī)關(guān)、事業(yè)單位、社會團(tuán)體、民辦非企業(yè)單位及其職工，都要參加。鄉(xiāng)鎮(zhèn)企業(yè)及其職工、城鎮(zhèn)個體經(jīng)濟(jì)組織業(yè)主及其從業(yè)人員是否參加基本醫(yī)療保險，由各省、自治區(qū)、直轄市人民政府決定。

新農(nóng)合必須是有農(nóng)村戶口才可以辦理。

2、繳費(fèi)主體不同。

職工醫(yī)療保險是指國家通過立法強(qiáng)制規(guī)定，用人單位和社會成員個人共同繳納醫(yī)療保險費(fèi)，建立醫(yī)療保險基金。

1、兩個系統(tǒng)不一樣。

新農(nóng)合是衛(wèi)生局的業(yè)務(wù)，而城鎮(zhèn)醫(yī)保屬于社保系統(tǒng)管。

2、籌資水平不同，報銷比例也有區(qū)別。

城鎮(zhèn)職工醫(yī)保政策范圍內(nèi)住院費(fèi)用報銷比例達(dá)80%以上，城鎮(zhèn)居民醫(yī)保和新農(nóng)合政策范圍內(nèi)住院費(fèi)用報銷比例分別達(dá)70%左右和75%左右。

3、參保人員類型不同。新農(nóng)合是由我國農(nóng)民自己創(chuàng)造的互助共濟(jì)的醫(yī)療保障制度。職工基本醫(yī)療保險是依法對職工的基本醫(yī)療權(quán)利給予保障的社會醫(yī)療保險。

4、卡內(nèi)余額使用不同

城鎮(zhèn)醫(yī)保卡個人